深圳大学MUSIC实验室推出一款软件神器,大大提升(3)
鉴于放射科对AI研究的重大需求,Pair新增了对放射影像DICOM RT Structure文件格式的全面支持。放射科医生将TPS?(Treatment Planning System)放疗规划系统中勾画的放疗靶区轮廓线以RT Struct格式导出后,可直接在Pair中打开,进行可视化和进一步的标注优化。Pair可支持超1000条RT轮廓线的标注交互。Pair更可以将RT Struct内的轮廓线填充并导出成分割标注结果文件,如nii, nii.gz等格式,极大地方便放射科医生使用专业的影像组学软件,如TexRAD、MaZda等,进行后续的高阶分析与研究。
PairCode --- 病例隐私脱敏和影像信息安全化软件在医学影像标注过程中,有效地保护患者隐私和确保标注资源的安全至关重要。现有的标注软件在标注流程上往往存在较高安全风险:
影像未脱敏,病人隐私信息无保护;
影像资源和标注结果资源存在高泄露风险;
为满足保护病患隐私信息和影像资源安全的需求,Pair提供了安全化辅助软件PairCode,为影像标注任务提供全流程的加密防护,实现标注资源的双重安全保护。PairCode提供如下两方面的功能:
DICOM影像脱敏
医学影像中,DICOM数据的头文件往往存有患者的隐私敏感信息。当原始数据在作为标注对象流动时,易发生患者隐私泄露。通过使用PairCode的数据脱敏功能,项目管理者可批量、自定义地擦除或修改敏感条目,如DICOM头文件信息中的患者信息、检查信息等,以保护患者隐私。
具体地,在PairCode的脱敏功能中,DICOM头文件中与隐私相关的信息被细分为五部分,用户可根据项目对头文件信息进行自定义的修改或删除操作。同时,PairCode会提供脱敏信息的查找密码本,记录头文件信息的原始内容和修改后的内容,以便于后续的回溯工作。PairCode可支持超10GB批量影像文件的处理。
标注资源加解密
为实现标注资源安全私有化、降低资源泄露风险,PairCode提供影像和标注的加解密功能,保障数据的安全流通:
项目管理者可对资源进行自定义加解密;
支持超过20种专业医学影像格式的便捷加解密;
非对称高阶加密,用户标注体验零负担。
PairCode提供公有加密和私有加密两种加密方式,加密后的影像和标注结果的查询和修改只能通过Pair软件进行,以此来保障数据安全。使用PairCode对数据进行加密后,标注人员仅需加载配置文件即可对加密影像进行标注工作,软件也将自动对标注结果进行加密,无需额外的手动加密操作。
实现Windows / Ubuntu / CentOS版本目前,Pair已实现了Windows 、Ubuntu和CentOS三种不同操作系统的版本,以满足医生、工程师和集群服务器的标注需求。用户可自主选择版本进行安装与使用。通过Pair不同操作系统版本进行标注的结果,可使用其他系统进行查看和修改,便于标注结果在项目小组成员间的流通。此外,Pair还设置了中英文两种语言版本,便于不同语种的用户进行使用。
专家用户评语
蔡跃新教授,中山大学孙逸仙纪念医院耳鼻喉科
“Pair软件真正实现了科研项目间的通用化标注支持,是我们尝试的其他标注软件所不能比的。我们团队的多个三维影像相关的AI研究项目,均采用Pair进行标注。项目开展期间,得到了Pair团队的及时响应与积极支持。希望Pair软件能发展得越来越好,更方便AI相关的研究,成为更多医生喜欢的软件。”
杨毅博士,四川大学华西医院骨科
“我们的CT三维影像的标注在遇到Pair软件后,得到了明显的提速和提质,课题也得以很快开展。它的功能简单直接,几乎没有学习难度,很多智能化标注功能令我印象深刻。PairCode软件也非常好地满足了我们对大批量影像脱敏的专业需求。Pair团队总是能很快处理我们提出的个性化需求,是很好的合作团队。希望Pair可以帮助降低AI研究的门槛,帮助更多医生更快更好地完成AI课题。”
张子健,医学物理师,中南大学湘雅医院肿瘤科
“在使用Pair软件之前,我们的数据标注工作随着不同的数据类型可能需要在不同的软件之间切换,但一次偶然的相遇,让我们团队接触到了Pair,它为我们团队的多模态数据标注,尤其是CT-PET的放疗勾画,提供了一个一体化的平台。Pair的使用简单易上手,大家标注的效率得到了极大的提高。在开展项目的部分场景,由于需要一些个性化的功能,也能得到Pair团队的充分支持。衷心希望Pair团队能越做越好,越做越强。”
文章来源:《音乐研究》 网址: http://www.ylyjzz.cn/zonghexinwen/2022/0423/1190.html